基因组数据库的核酸序列数据库

GenBank核酸序列数据库涵盖了从完整基因组到单个基因等序列数据及部分注释信息，称一次数据库。此外，还有些更有针对性的基因组资源，或称专用数据库。这些专用数据库既包括了上述一次数据库的部分数据，也包括从其它数据库资源获得的信息或交叉链接。这种专门数据库主要分为两大类，一类是模式生物基因组数据库，另一类则与特殊的测序技术有关。这类数据库尽管也包含序列数据，但它们的特色主要是为某一特定的模式生物提供一个完整的数据资源，如酵母（Saccharomyces cerevisiae）、线虫（Caenorhabditis elegans）、果蝇（Drosophila melanogaster）、拟南芥（Arabidopsis thaliana）、幽门螺杆菌（Helicobacter pylori）等。这些数据库从各个不同层次上搜集整理有关信息，以便对某个模式生物全基因组有一个更加完整的了解。

求助：NT和NR数据库的详细介绍和区别

不同的测序原理不一样，分别概述如下：第一代测序，1.1 Sanger 测序　采用的是直接测序法；1.2 连锁分析　采用的是间接测序法。新一代测序 (NGS)主 要 包 括 全 基 因 组 重 测 序 (whole-genomesequencing，WGS)、全外显子组测序

(whole-exomesequencing，WES) 和目标区域测序 (Targeted

regionssequencing，TRS)，它们同属于新一代测序技术：1 目标区域测序　目前常用的是基因芯片技术；2 全外显子组测序 (WES)　外显子组是单个个体的基因组 DNA 上所有蛋白质编码序列的总合，基因测序结果与NCBI的SNP数据库、千人基因组数据库等国际权威数据库比对，最终确定是否为突变基因。

原理很简单后者是前者的子集。chromosome只包含所有已经测序的基因组数据。估计你的序列可能只是在高等生物中保守，所以才会出现选择chromosome数据库时相似数量下降非常多。 在做BLAST的时候，我们通常需要根据不同的目的选择不同的数据库。

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