植物中,SSR的PCR扩曾产物,进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,分析时,怎么判断共显性条带?
在植物中,SSR(简单序列重复)的PCR扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分析时,可以通过以下方法来判断共显性条带:
1. 观察凝胶上的条带:在聚丙烯酰胺凝胶电泳完成后,观察凝胶上的条带。如果一个位点上出现两条或两条以上的条带,则表明这是共显性位点,因为这些条带代表了不同的等位基因形式。
2. 计算条带的分子量:通过比较条带的分子量来判断是否为共显性位点。如果不同的条带具有不同的分子量,那么这是共显性位点的表现之一,因为不同的等位基因具有不同的DNA序列,进而产生具有不同分子量的片段。
3. 观察条带的颜色:如果使用荧光染料等显色方法进行染色,可以通过观察条带的颜色来判断是否为共显性位点。如果一个位点上出现两种或两种以上颜色的条带,则表明这是共显性位点,因为不同的等位基因产生不同的荧光颜色。
4. 通过序列分析确定:对于一些难以判断的位点,可以通过将凝胶上分离的DNA片段进行序列分析来确定是否为共显性位点。通过比较序列,可以发现是否存在不同的等位基因形式。
需要注意的是,在进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分析时,有时会出现非特异性扩增或杂带等干扰,影响结果的判断。因此,在进行共显性位点分析时,需要仔细考虑凝胶结果,同时结合其他分析方法,以确保结果的准确性。
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