氨基酸常用的打分矩阵有:pam 和blosum;两者有何区别?

氨基酸常用的打分矩阵有:pam 和blosum;两者有何区别?介绍如下：

PAM（Point Accepted Mutation）和BLOSUM（BLOcks SUbstitution Matrix）都是氨基酸打分矩阵，但它们在构建方法和适用范围上有一些区别。

PAM矩阵是在1978年由Dayhoff提出的，它基于一个假设，即在一个进化过程中，一个位置上氨基酸的替换是可以接受的，只要这个替换在进化过程中出现的频率足够高。PAM矩阵被广泛用于构建进化模型，以及进行进化和亲缘关系分析。

BLOSUM矩阵是1992年由Henikoff和Henikoff提出的，它的构建基础是假定在同一物种内或亲缘关系较近的物种间，氨基酸替换的概率与氨基酸物理化学性质的距离成正比。BLOSUM矩阵被广泛用于蛋白质序列比对和进化分析。

总的来说，PAM矩阵更强调进化的保守性，而BLOSUM矩阵则更强调氨基酸替换的适应性。因此，在某些情况下，PAM矩阵可能会更适用于分析亲缘关系较远的物种，而BLOSUM矩阵则可能更适用于分析亲缘关系较近的物种。

针对贵司的污水和电镀废水较为相似，含有大量金属阳离子，应该使用阴离子聚丙烯酰胺。 正常情况下针对未知成分的污水如何选择PAM呢？但在一般条件下，需要处理的原水被倒入一个量筒内，并静置一小时。如果大部分污泥已经沉淀，则可以单独使用聚丙烯酰胺进行处理。

先用具有代表性的阴离子、非离子及阳离子高分子量聚丙烯酰胺进行试验。选择能够产生稳定絮状物的聚丙烯酰胺。区别其离子是阴离子还是阳离子。然后通过对比弱、中、强阴离子以及阳离子来确定选用最佳的聚丙烯酰胺类型。

确定适当的聚丙烯酰胺类型后，从该类型中选择两到三种产品。确定最佳产品的剂量，以产生最佳沉淀速度、透明度和脱水效果。

聚丙烯酰胺的使用效果根据被处理原水的状态而有所不同。原水中悬浮物的种类、大小、浓度及PH等都会依水质而不同。另外需要注意的是，这些条件通常也会不断地发生变化。众所周知，搅拌条件也会影响絮状物形成的状态。因此，为了获得最佳结果，我们需要调整PH值和搅拌条件。需要使用的高分子聚丙烯酰胺产品将因絮凝沉淀、加压气浮、污泥脱水及其它处理目的而有所不同。为了选择最佳的聚丙烯酰胺产品，用户必须考虑到上述因素，并做出与实际使用条件极其相似的选定试验。

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