CZE、CGE、CIEF、ACE的原理分别是什么?
答案:毛细管区带电泳(CZE)的原理为,当电流通过时,缓冲液中的阳离子、阴离子分别以恒定的速率向阴极和阳极移动,试样中的各个组分也按各自的特定速率迁移,即缓冲液的离子流动中伴随有试样离子的流动。由于试样中各个组分间质荷比的差异,以不同的速率在分立的区带内进行迁移。如果试样中各个组分的迁移率差别较大,可以使各组分分离。
毛细管凝胶电泳(capillary gel electrophoresis, CGE)是以起“分子筛”作用的凝胶作为支持介质的区带电泳,是按照试样中各个组分相对分子质量的大小进行分离的方法。
毛细管等电聚焦(capillary isoelectric focusing, CIEF)是基于不同蛋白质或多肽之间等电点的差异进行分离的电泳技术。蛋白质分子是典型的两性电解质,所带电荷与溶液pH有关,在酸性溶液中带正电荷,在碱性溶液中带负电荷。当其表观电荷数等于零时,溶液的pH称为蛋白质的等电点(isoelectric point, pI)。不同蛋白质的等电点不同,当向毛细管内的两性电解质载体两端施加直流电压时,将建立一个由阳极到阴极逐步升高的pH梯度。因此,不同等电点的蛋白质在电场作用下迁移至毛细管内pH等于其等电点的位置,形成一个窄的聚焦区带而得到分离。
亲和毛细管电泳(affinity capillary electrophoresis, ACE)是利用配体与受体之间存在特异性相互作用,可以形成具有不同质荷比的配合物而达到分离目的。通过测定配合物迁移时间与缓冲液中配体浓度之间的关系,可以求算出结合常数。
observed species指数,chao指数和ace指数区别为:性质不同、变化不同、引入变量不同。
一、性质不同
1、observed species指数:observed species指数表示该样品中含有的物种数目。
2、chao指数:chao指数估算样品中所含OTU数目的指数。
3、ace指数:ace指数评估样本中物种组成的丰富度和均匀度。
二、变化不同
1、observed species指数:observed species指数的数值越高表明样品物种丰富度越高。
2、chao指数:chao指数的数值越大代表样本中所含物种越多。
3、ace指数:ace指数的数值越大表示该环境的物种越丰富,各物种分配越均匀。
三、引入变量不同
1、observed species指数:observed species指数引入了物种丰度的变量,通过菌群结构数据与某种给定的因素互相拟合来探寻样本、物种两两之间的关系。
2、chao指数:chao指数引入了生物因子的变量,通过组内物种组成及表达和组间物种表达趋势,结合离群样本判断探寻样本、物种两两之间的关系。
3、ace指数:ace指数引入了环境因子的变量,通过置换检验来探寻样本、物种、环境三者之间的关系。
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