新一代测序中,基因从头测序和重测序有什么区别?我要做乙肝病毒DNA全长测序,应该选用哪种方法?
1、条件不同
从头测序的条件是不依赖于任何物种基因组;重测序的条件是在已知物种基因组的情况下进行的。
2、病毒变异率不同
从头测序是通过拼接和组装的方式获得基因组序列图谱,病毒变异率很低;重测序可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点,插入缺失位点,结构变异位点,拷贝数变异等变异信息,从而获得生物群体的遗传特征。病毒变异率很高。
乙肝病毒在医学上已经测过,只需要做重测序就可以。
扩展资料:
从头测序的原理是生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。
可以区分长度仅差一个核苷酸的不同DNA分子的条件下,对各组寡核苷酸进行电泳分析,只要把几组寡核苷酸加样于测序凝胶中若干个相邻的泳道上。
全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。
SBC将不同梯度插入片段的测序文库结合短序列、双末端进行测序,帮助客户在全基因组水平上扫描并检测与重要性状相关的基因序列差异和结构变异,实现遗传进化分析及重要性状候选基因预测。
百度百科-从头测序
百度百科-全基因组重测序
问题一:个人全基因组重测序需花费多少钱? 人类基因组大小3G, 重测序一般需要测定至少20x以上的数据(数据乘数高的话对于信息分析是有海的),也就是说一般需要测定60G的数据,如果1G按照5000元算的话,需要30万元。
不过要看你的目的,现在illumina推出的my-seq测1个人的好像只需要几万。
问题二:人类基因组测序:目前到底发现了多少个基因 全部人类基因组约有2.91Gbp,约有39000多个基因;平均的基因大小有27kbp
目前已经发现和定位了26000多个功能基因,其中尚有42%的基因尚不知道功能
基因数量少得惊人:一些研究人员曾经预测人类约有14万个基因,但Celera公司将人类基因总数定在2.6383万到3.9114万个之间,不超过40,000,只是线虫或果蝇基因数量的两倍,人有而鼠没有的基因只有300个。如此少的基因数目,而能产生如此复杂的功能,说明基因组的大小和基因的数量在生命进化上可能不具有特别重大的意义,也说明人类的基因较其他生物体更'有效',人类某些基因的功能和控制蛋白质产生的能力与其他生物的不同。
问题三:个人基因组测序有哪些意义 理论上说,知道了序列,就可以确定这个人的基因,从而能够知道这个人的表型特征,或者对那些病是易感的,以后有可能得什么病,以及对将来对孩子的遗传等等…
但目前来说,个人的全基因组还没有什么用,因为现在我们对基因组中序列的信息了解的还太少,如SNP相关疾病,多基因遗传病等。在科研上全基因组测序,可以为我们提供数据库,以便分析相关的特征。
随着代号为AK1的韩国人的测序成功,目前世界上只有5个人进行了,全基因组测序,另外四个是:一名非洲优鲁巴人、基因研究的先驱詹姆斯?沃森、克里格?文特和一名代号为YH的中国人。
问题四:“人类基因组计划”对人类全部染色体的基因进行测序,你认为该计划测定人类染色体数应该是( )A.16 人体内每个细胞内有23对染色体;包括22对常染色体和一对性染色体,性染色体包括:X染色体和Y染色体.含有一对X染色体的受精卵发育成女性,而具有一条X染色体和一条Y染色体者则发育成男性.即男性染色体的组成:22对常染色体+XY,女性染色体的组成:22对常染色体+XX,因此人类基因组计划要测定的人类染色体数应该是22条常染色体和两条性染色体X和Y,即24条.故选:B.
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