DNA和RNA提取原理是什么？还有相关试剂盒的原理，各步的作用~~

TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚／SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比，最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质．TRIzol使样品匀浆化，细胞裂解，溶解细胞内含物，同时因含有RNase抑制剂可保持RNA的完整性。在加入氯仿离心后，溶液分为水相和有机相，RNA在水相中。取出水相用异丙醇沉淀可回收RNA；用乙醇沉淀中间层可回收DNA；用异丙醇沉淀有机相可回收蛋白质。

TRIzol试剂可用于小量样品（50-100mg组织、5×106细胞）也适用于大量样品（≥1g组织、>107细胞）。对人，动物，植物组织，细菌均适用，可同时处理大量不同样品，整个提取过程在一小时内即可完成。分离的总RNA无蛋白质和DNA污染，可用于Northern Blot，dot blot，ployA筛选，体外翻译，RNase保护分析和分子克隆。在用于RT-PCR时如果两条引物存在于一个单一外显子内，建议用无RNase的DNaseⅠ处理RNA样品，避免出现假阳性。共纯化的DNA可用作标准，比较不同样品RNA的得率，也可用于PCR和酶切。蛋白质可用于Western Blotting。

预防RNase污染注意事项：

1． 经常更换新手套，皮肤上常带有的细菌，霉菌可能成为RNase的来源。

2． 使用灭过菌的RNA专用塑料制品避免交*污染。

3． RNA在TRIzol试剂中时不会被RNase污染，但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小时，塑料制品可在0.5M NaOH中浸泡10分钟，然后用水彻底清洗，高压灭菌，即可去除RNase。

4． 配制溶液应使用无RNase的水（将水加入处理过不含RNase的玻璃瓶中，加入DEPC至终浓度0.01℅v/v,放置过夜,高压灭菌。注：DEPC有致癌之嫌，需小心操作。）

RNA的提取

准备试剂：氯仿，异丙醇，75℅乙醇，无RNase的水或0.5℅SDS(溶液均需用DEPC处理过的水配制)

操作步骤:

1. 匀浆处理:a.组织 将组织在液氮中磨碎,每50-100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过TRIzol体积10℅。

b.单层培养细胞 直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞，每10cm2面积(即3.5cm直径的培养板)加1ml，用移液器吸打几次。TRIzol的用量应根据培养板面积而定，不取决于细胞数。TRIzol加量不足可能导致提取的RNA有DNA污染。

c．细胞悬液 离心收集细胞，每5-10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞加入1ml TRIzol，反复吸打。加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。

2．将匀浆样品在室温（15-30℃）放置5分钟，使核酸蛋白复合物完全分离。

3．可选步骤：如样品中含有较多蛋白质，脂肪，多糖或胞外物质（肌肉，植物结节部分等）可于2-8℃10000×g离心10分钟，取上清。离心得到的沉淀中包括细胞外膜，多糖，高分子量DNA，上清中含有RNA。处理脂肪组织时，上层有大量油脂应去除。取澄清的匀浆液进行下一步操作。

5. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿，剧烈振荡15秒，室温放置3分钟。

6. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层：底层为**有机相，上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中，水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。

7. 把水相转移到新管中，如要分离DNA和蛋白质可保留有机相，进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1ml TRIzol加入0.5ml异丙醇，室温放置10分钟。

8. 2-8℃10000×g离心10分钟，离心前看不出RNA沉淀，离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。移去上清。

9. 用75℅乙醇洗涤RNA沉淀。每使用1ml TRIzol至少加1ml 75℅乙醇。2-8℃不超过7500×g离心5分钟，弃上清。

10.室温放置干燥或真空抽干RNA沉淀，大约晾5-10分钟即可.不要真空离心干燥，过于干燥会导致RNA的溶解性大大降低。加入25-200μl无RNase的水或0.5℅SDS,用枪头吸打几次,55-60℃放置10分钟使RNA溶解.如RNA用于酶切反应,勿使用SDS溶液。RNA也可用100℅的去离子甲酰胺溶解，-70℃保存。

注意事项：

1.从少量样品（1-10mg组织或102-104细胞）中提取RNA时可加入少许糖原以促进RNA沉淀。例如加800ml TRIzol匀浆样品，沉淀RNA前加5-10μg RNase-free糖原。糖原会与RNA一同沉淀出来，糖原浓度不高于4mg/ml是不影响第一链的合成，也不影响PCR反应。

2．匀浆后加氯仿之前样品可以在-60至-70℃保存至少一个月。RNA沉淀可以保存于75% 酒精中2-8℃一星期以上或-5至-20℃一年以上。

3．分层和RNA沉淀时也可使用台式离心机，2600×g离心30-60分钟。

预期产量：1mg组织或1×106细胞提取RNA分别为：

肝和脾6-10μg ,肾3-4μg ,骨骼肌和脑组织1-1.5μg ,胎盘1-4μg ,上皮细胞8-15μg ,成纤维细胞5-7μg 。

常见问题分析：

得率低：A.样品裂解或匀浆处理不彻底

B．RNA沉淀未完全溶解

A260/A28012000×g离心10分钟除去。

DNA的定量：取一份溶于8mM NaOH的DNA加水测A260值。一单位A260值相当于50μg/ml双链DNA。根据DNA产量可估计细胞数，人，大鼠，小鼠1×106二倍体细胞含DNA的量分别为7.1μg , 6.5μg , 5.8μg 。

预期产量：1mg组织或1×106细胞提取DNA分别为肝和肾3-4μg 骨骼肌，脑组织，胎盘2-3μg 人，大鼠，小鼠培养细胞（1×106）5-7μg 成纤维细胞5-7μg

应用：1.用于PCR 溶于8mM NaOH的DNA用0.1M HEPES调pH至8.4,取0.1-1μg DNA用作模板。

2.酶切反应 用HEPES或1mM EDTA调节pH至适当值。每μg DNA使用3-5单位的酶，80-90%的DNA是可消化的。

1ml 8mM NaOH溶解的DNA样品pH值调节

Final pH 0.1M HEPES(μl) Final pH 1M HEPES(μl)

8.4 86 7.2 23

8.2 93 7.0 32

8.0 101

7.8 117

7.5 159

注意事项：

1. DNA在中间层和有机相中时可在2-8℃保存过夜。

2．DNA沉淀在75%乙醇中2-8℃可保存几个月。

3．DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜，如长期保存需用HEPES调节pH至7-8并且加EDTA至1mM，可置于4℃或-20℃长期保存。

缓冲液名称及常用浓度 缓冲H范围

MES(2吗啉代乙磺酸) 5.5-6.7

Bis-Tris 5 8-72

HEPES 6.8-8.2

PIPES 61-75

MOPS 6.5-7.9

Tricine 7.4-8.8

TEA(三乙醇胺) 7.4-8.3

甘氨酸-盐酸缓冲液(0.05mol/L) 2.2-5.0

邻苯二甲酸-盐酸缓冲液(0.05mol/L) 2.2-3.8

砖酸氨二钠-柠檀酸缓冲清 2.2-8.0

柠檬酸-氢氧化钠-盐酸缓冲液 2.2-6.5

柠模酸-柠椗酸钠缓冲液(0.1mol/L) 3.0-6.6

乙酸-乙酸钠缓冲液(0.2mo1/L) 3.6-5.8

邻苯二甲酸氯钾-氧氧化钠缓冲液 4.1-5.9

磷酸氢二钠-磷酸二氢钠缓冲液(0.2mol/L) 5.8-8.0磷酸氨二钠-磷酸二氢钾缓冲液(1/15mol/L)492-8.18磷酸二氢钾-氢氧化钠缓冲液(0.05mol/L)

5.8-8.0

巴比妥钠-盐酸缓冲液(18℃) 6.8-9.6

Tris-盐酸缓冲液(0.05mol/L 25℃) 7.10-9.00

甘氨酸-氢氧化钠缓冲液(005mo1/L) 8.6-10.6

硼砂-氢氧化钠缓冲液(0.05mol/L) 9.3-10.1

碳酸钠-碳酸氢钠缓冲液(0.lmol/L) 9,16-10,83

碳酸钠-氢氧化钠缓冲液(0.025mo1/L) 9.6-11.0

砖酸氛二钠-氧氧化钠级冲液 10.9-12.0

氯化钾-盐酸缓冲液(0.2mol/L) 1.0-2.2

氯化钾-氢氧化钠缓冲液(0.2mol/L) 12.0-13.0

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