微生物分类表或分类的详细步骤和方法?
微生物分类的目的:把各种微生物按照它们的亲缘关系分群归类,排成系统,以便于人们对微生物进行鉴定和交流。
微生物的主要分类单位:界、门、纲、目、科、属、种、变种、亚种(小种)、型、菌株(品系)
种是最基本的分类单位
种:亲缘关系较近的微生物有机体的集合,它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源性≥70%
变种:从自然界分离到的微生物纯种,如果与典型种之间存在某些特征的差别,而这些特征又是稳定遗传的,则可将这一纯种称为典型种的变种。如枯草芽孢杆菌的黑色变种。
小种(亚种):实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。
型:自然界存在的差异较小的同种微生物的不同类型,称为型。如结核分支杆菌依其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型。
菌株(品系):来源不同的同种微生物的纯培养,均可称为菌株。
群:有些微生物的特征介于两种微生物之间,我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群命名的方法:国际法规命名,即林奈所创立的双名法。
双名法的规则:微生物的学名依属和种而命名,由两个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成,属名在前,为名词,开头字母大写,是该微生物的主要特征。种名在后,为形容词。如:Stapylococcus
aureus,
Streptomyces
albosporeus(Krainsky)
Waksman
et
Henrici,
Micrococcus
sp.(spp.),
Bacillus
subtilis
var.niger形
态
特
征:个体形态(形状、大小、染色反应等)、群体形态(菌落特征、液体培养特点等)
生理生化特征:代谢产物、营养要求、细胞壁成分等的测定
生态特征:微生物间各种相互关系的利用
遗传特征:DNA同源性分析
G+C的含量
其它:全细胞蛋白的分析、多位点酶的分析等
经典分类法:采用双歧法整理实验结果
数值分类法:测定100项以上的各种性状,利用计算机进行菌株的相互比较,并得出总的相似值。一般认为同种微生物菌株之间的相似值≥80%。
遗传分类法:DNA杂交(液相复性速率法原理与方法)、G+C含量的测定(热变性法、浮力密度法等)
细菌:伯杰氏鉴定细菌学手册(第八、第九版)、细菌系统学手册(第一版)
放线菌:中国科学院微生物研究所编著的放线菌目分科、分属检索表
真菌:Smith、
Alexopoulos
、
Ainsworth的分类系统
1、细胞的形态和习性水平
观察细胞的形态特征、运动性、酶反应、营养要求和生长条件等。
2、细胞组分水平
细胞组成成分例如细胞壁成分,细胞氨基酸库,脂类、醌类、光合色素等的分析。
3、蛋白质水平
氨基酸序列分析、凝胶电泳和各种免疫标记技术。
4、核酸水平
核酸分子杂交,G+C mol%值的测定,遗传信息的转化和转导,16S或18S rRNA寡核苷酸序列分析,重要基因序列分析和全基因组测序等。
常见的几种微生物分类概念
种:亲缘关系较近的微生物有机体的集合,它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源性>=70%
变种:从自然界分离到的微生物纯种,如果与典型种之间存在某些特征的差别,而这些特征又是稳定遗传的,则可将这一纯种称为典型种的变种。如枯草芽孢杆菌的黑色变种。
小种(亚种):实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。
型:自然界存在的差异较小的同种微生物的不同类型,称为型。如结核分枝杆菌以其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型。
菌株(品系):来源不同的同种微生物的纯培养,均可称为菌株。
群:有些微生物的特征介于两种微生物之间,我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群。
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