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在企业产生中,如何理解tpm和标准化作业

小肉包1年前 (2023-12-02)阅读数 11#综合百科
文章标签样本基因

TPM就是要打破生产和维护之间的壁垒,让一线员工参与到设备维护中来,成为设备的主人。在实际的生产运营过程中,很多设备的故障是由于操作的不当造成的。如何避免这样的错误对设备造成的伤害,采用标准化作业的方式就可以达到这样的目标。

TPM的自主保养是很重要的一个支柱,然而在实际的推展过程中,往往会遇到很大的麻烦。例如一线员工在没有得到培训,并且没有标准规范的情况下,盲目的参与设备维护,就会适得其反。一方面无法达到维护的目的,另一方面挫伤了员工主动参与的积极性。在实际的工作过程中我们采用“七定法”来规范我们的自主点检的规范。

1、定部位

确定我们要对那些部位进行点检,比如:动力系统,电器系统,控制系统,液压系统,启动系统等。

2、定项目

确定要点检的项目内容,比如:灰尘,杂物,跑冒滴漏;腐蚀,磨损,变形,裂纹,松动,震动,议程声音;温度,气压,液压,液位等。

3、定方法

确定如何点检,用那种工具点检。自主点检主要利用五感进行点检,视觉,听觉,嗅觉,触觉等。

4、定标准

点检就是对设备部位的优劣进行判断,可以量化的尽可能量化,不可以量化的也要描述清楚规范要求。

5、定周期

一般的周期可以分为:每班,每日,每周,每月,每季度,每年等。

6、定人员

明确哪些项目该有谁来负责,谁来实施。一般分为操作人员和维护人员,分别对应自主保养和专业保养。

7、定条件

点检的内容是否需要停机来实施,有些内容必须停机才可以实施,有些可以在开机状态实施,需要做明确的规定。

有了这样的规范和标准,就可以提升自主点检的效果,同时提高了点检的效率,为推进TPM活动打下一个良好的基础。

RPKM,FPKM和TPM明确解释

转录组测序中,常见的几种reads count值的标准化方法,基于测序深度和基因长度进行标准化。

RPKM(Reads Per Kilobase Million)计算方法:

计算样本中的总reads数,然后将其除以1000000,获得百万缩放因子。

将每个基因的reads count值,除以百万缩放因子标准化测序深度,获得每百万reads中来自该基因的reads比例(reads per million,RPM)。

将RPM值除以基因长度(以千碱基为单位),获得RPKM。

FPKM(Fragments Per Kilobase Million)与RPKM非常相似:

RPKM是针对单端测序而言,其中每个reads对应于一个已测序的片段;FPKM用于双端测序,两个reads(分为R1和R2端)对应一个测序片段(fragments)。RPKM和FPKM之间的唯一区别是FPKM考虑到成对的reads来源于一个DNA片段的测序,因此它不会来自同一fragments的reads进行两次计数。

TPM(Transcripts Per Kilobase Million)与RPKM和FPKM也比较相似,但计算顺序略有不同:

将每个基因的reads count值除以每个基因的长度(以千碱基为单位),获得基因的每千碱基reads覆盖数(reads per million,RPK)。

计算样本中所有RPK值,然后除以1000000,获得百万缩放因子。

将RPK值除以百万缩放因子,获得TPM值。

因此可看到,TPM与RPKM和FPKM相比,唯一的区别是先对基因长度进行归一化,然后对序列深度进行归一化。但是这种差异的影响非常明显。

使用TPM时,每个样本中所有TPM的总和是相同的,这样可以更轻松地比较每个样本中映射到基因的reads比例。使用RPKM和FPKM,每个样本中的标准化reads之和可能会有所不同,这使得直接在样本间比较更加复杂。

所以TPM方法正越来越流行。

如果样品1中基因A的TPM为3.33,而样品B中的TPM为3.33,则可以认为这两个样品中映射到基因A的总reads数的比例完全相同,因为两个样本中的TPM的总和始终为相同的数字(因此,无论要查看哪个样本,计算比例所需要的分母都是相同的。

使用RPKM或FPKM,每个样本中的标准化读数之和可能不同,此时如果样本1中基因A的RPKM为3.33,样本2中的RPKM为3.33,则难以获知两个样本中映射到基因A中reads的比例是否相同,这是因为计算比例所需的分母在两个样本之间可能是不同的。

来自StatQuest

过去,当您进行RNA测序时,您以RPKM(Reads Per Kilobase Million 每千碱基百万个读数)或FPKM(Fragments Per Kilobase Million 每千碱基百万个碎片)报告结果。但是,TPM(Transcripts Per Kilobase Million每千碱基记录本)现在变得非常流行。由于这些术语似乎有很多混乱,我认为我将使用StatQuest清除所有内容。

这三个指标试图对测序深度和基因长度进行标准化。这是针对RPKM的操作方法:

FPKM与RPKM非常相似。RPKM是针对单端RNA-seq制作的,其中每个读数对应于一个已测序的单个片段。FPKM用于配对末端RNA-seq。使用成对末端RNA-seq,两个读段可以对应一个片段,或者,如果该对中的一个读段没有作图,则一个读段可以对应一个片段。RPKM和FPKM之间的唯一区别是FPKM考虑到两次读取可以映射到一个片段(因此它不会对该片段进行两次计数)。

TPM与RPKM和FPKM非常相似。唯一的区别是操作顺序。这是您计算TPM的方法:

因此,您会看到,在计算TPM时,唯一的区别是先对基因长度进行归一化,然后对序列深度进行归一化。但是,这种差异的影响非常深远。

使用TPM时,每个样本中所有TPM的总和是相同的。这样可以更轻松地比较每个样本中映射到基因的读段的比例。相反,使用RPKM和FPKM,每个样本中的标准化读数之和可能会有所不同,这使得直接比较样本变得更加困难。

这是一个例子。如果样品1中基因A的TPM为3.33,而样品B中TPM为3.33,则我知道这两个样品中映射到基因A的总读数的比例完全相同。这是因为两个样本中的TPM的总和总是相同(因此,无论您要查看的是什么样本,计算比例所需要的分母都是相同的。)

使用RPKM或FPKM,每个样本中的标准化读数之和可能不同。因此,如果样本1中基因A的RPKM为3.33,样本2中的RPKM为3.33,我将不知道样本1中与基因2映射的基因A的读取比例是否相同,这是因为分母需要计算两个样本的比例可能会有所不同。

在企业产生中,如何理解tpm和标准化作业

来源– StatQuest

标签: FPKM rpkm StatQuest TPM

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